新疆部分规模化养猪场中猪圆环病毒2型和3型监测

known 发布于 2025-07-28 阅读(220)

中图分类号:S852.3 文献标志码:A 文章编号:1001-4330(2025)02-0502-08

0 引言

【研究意义】猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)是目前已知最小的DNA单股病毒,其直径为 ,二十面体对称结构,同时也是可以在哺乳动物细胞内复制的最小DNA病毒之一。PCV2和PCV3病原已在全球流行,给养猪行业带来经济损失。【前人研究进展】目前PCV分为4个基因型,分别是PCV1、PCV2和新发现的PCV3、PCV4。PCV1于1974年在猪肾细胞系PK15中发现,无致病性[1]。PCV2在1998 年首次分离得到,是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征的主要病原[2]。PCV3病毒可引起心脏和多系统炎症、仔猪消瘦腹泻及母猪繁殖障碍疾病等。【本研究切入点】PCV2感染猪后对机体获得性免疫能力的建立影响重大,主要包括在全身性淋巴细胞衰竭和组织细胞浸润增殖[3-7]。造肥淋巴器官的细胞凋亡,使宿主产生严重的免疫抑制效。猪只感染PCV3后会引起宿主细胞自噬、凋亡等,对先天免疫与炎症反应有一定影响,临床表现为被毛粗乱、腹式呼吸、繁殖障碍疾病等。呼吸困难、体重减轻,个别猪只会出现腹泻、黄疸等。目前新疆对PCV2和PCV3的研究较少,需阐明PCV2和PCV3在新疆的流行情况。【拟解决的关键问题】研究采集7个规模化养猪场样品检测病原,调查PCV2和PCV3流行状况,为PCV2和PCV3的防控和流行病学调查提供科学依据。

材料与方法

1.1 材料

1.1.1采样

2022年10月至2023年9月,在新疆选取7个规模化养猪场,定期前往场区采集样品,采集新生健康乳猪辜丸液样品523份,健康猪精液样品364份,病弱猪血清样品208份(乳猪血清样品31份、保育仔猪血清样品69份,育肥猪血清样品63份,妊娠母猪血清样品45份),死亡猪组织样品200份(心、肝、脾、肾、肺混样),流产死胎样品22份,病弱猪脐带样品86份,共计1403份样品。表1

表1 各厂区采样信息

1. 1.2 仪器和耗材

仪器:全自动核酸提取仪(北京标驰泽惠生物科技有限公司),组织研磨仪(析牛科技公司);离心机和移液枪(力辰仪器科技有限公司);荧光PCR仪(拓赫机电科技有限公司)。

耗材:移液枪头(比克曼生物科技有限公司);快速磁珠法DNA/RNA提取试剂盒(北京标驰泽惠生物科技有限公司); 2 . 0 m L EP管和1.5mLEP管(力辰仪器科技有限公司);八连排(爱思进生物技术(杭州)有限公司);精液处理液(爱德士生物科技有限公司);PCV3型荧光PCR检测试剂盒(内蒙古金迈诗生物科技有限公司)。

1. 1.3 PCV2引物和探针设计

猪圆环2型病毒引物和探针根据GB/T35901 设计,探针及引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。表2

1. 1.4 PCV2标准品制备

所需标准品,据GenBank中公布的PCV2基因序列由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

表2 引物和TaqMan探针序列Tab. 2 Primer and TaqMan probe sequences

1.1.5 PCV3引物、探针和标准品的来源

PCV3引物、探针和标准品均由内蒙古金迈诗生物科技有限公司提供。

1.2 方法

1.2.1 试验设计

组织样品、脐带样品、死胎样品处理方式:每份样品按 的重量剪取后放入 2 . 0 m L 无菌EP管中,加入适量灭菌生理盐水,经组织研磨仪研磨后放离心机, 离心 ,取上清液1 . 0 m L ,置于无菌 1 . 5 m L EP管中, - 2 0 % 冰箱保存备用。

血清处理:全血常温静置,析出血清并转移血清至 1 . 5 m L 无菌EP管内, 离心5m i n ,取血清上清液 1 . 0 m L 置于 1 . 5 m L 无菌EP中,标记血清信息,放入 冰箱冷冻保存备用。

精液处理:取 1 m L 精液样本于 1 . 5 m L 的离心管中, 1 2 0 0 0 r / m i n 离心 4 m i n ,弃上清留沉淀,加入 4 0 0 μ L ReaL PCR 缓冲液(精液处理液)吹打混匀后 7 0 % 温浴 离心 1 m i n ,取 4 0 0 μ L 澄清裂解液于管中 1 . 5 m L 的离心管中备用。标记好样品信息进行检测。

1. 2.2 核酸提取。

预封装试剂准备:从试剂盒中取出预封装试剂,多次颠倒使融珠重悬,轻轻摇动孔板,使试剂和磁珠集中在孔板底部,小心撕去铝箔封口膜,使用前请确认板子方向。撕封口膜时避免振动,防止液体溅出。

自动化仪器提取步骤:在96孔板试剂的第1列和第7列(注意有效工作孔位)中加入 3 0 0 μ L 样本(投入体积可兼容 1 0 0 ~ 4 0 0 μ L 。将96深孔板放入核酸提取仪中,装上磁棒套,确认磁棒套安装到位,进行自动化提取。自动化程序结束后,将第6列和12列孔中(注意有效工作孔位)的洗脱液转移至干净的离心管中;如不立刻使用,请将洗脱立物置于 - 2 0 % 保存。

1.2.3检测

1.2.3.1 PCV2检测

(1)将PremixExTaq、引物、探针(要注意通光放置)RNaseFree 和持检测样品已提取好的DNA,充分混后置于冰盒上待用。

(2)在 0 . 2 m L PCR八联排中、Premix Ex Taq(ProbeqPCR)试剂盒说明书比例配制试剂。 2 × Premix E x Taq为 1 2 . 5 μ L ,分别为PCV2上游引物1 μ L 、PCV2下游引物 1 μ L 、PCV2探针 1 μ L 、RNase free 和总体积 2 4 μ L 。

(3)在上述(2)分装好的反应体系中加人2μ L 的样品。

(4)将配制好的试剂,放入PCR仪中进行扩增,反应条件: 5 0 % 预反应 反应10 ,扩增40个循环,在 时收集荧光

(5)荧光定量PCR通道选择:为FAM(PCV2)单通道。

(6)阳性:被检样品 C t 值 ⩽ 3 5 并出现特异性扩增曲线为阳性;可疑:被检样品 C t 值 gt; 3 5 并出现特异性扩增曲线,判为可疑,需进行复测;如仍是可疑则判为阳性。阴性:被检样品无 C t 值。对于某些未呈现S型曲线,但本底较高的样品,应判定为阴性。

1.2.3.2 PCV3检测程序

(1)取出PCR反应液A和PCR反应液B,待其融化后,充分混匀、瞬时离心后放置于冰盒上备用。

(2)反应体系配制:PCR反应液A 2 . 0 μ L× ,PCR反应液 B 2 1 . 0 μ L× ( n + 1 ) ,总体积为 2 3 . 0 μ L× ( n+ 1 ) 。

(3)根据待测样品、阴性对照、阳性对照总数量,准备 0 . 2 m L PCR八联管,向每个管中加入23μ L PCR反应体系。

(4)吸取上样品核酸、阴性对照和阳性对照各 2 μ L ,加人对应 0 . 2 m L PCR八联反应管中,盖好管盖转移到扩增区。

(5)反应程序设定: 预反应 反应5s ,扩增40个循环,在 5 7 % 时收集荧光。

(6)荧光定量PCR通道选择:为FAM(PCV3)单通道。

(7)结果判定:若待检样品的扩增曲线呈标准S曲线,且 Ct 值 ⩽ 3 5 ,则结果判定为阳性。若待检样品 C t 值 gt; 3 8 ,则结果判定为阴性。若待检样品 3 5 lt; C t 值 lt; 3 8 ,则结果判定为可疑,即该样品需复检。

1.3 数据处理

阳性样品提交圣湘生物科技股份有限公司测序,样品编号为 P C V 3- X J- 0 0 7 和PCV3-XJ-008。将测序结果在NCBI网站进行比对,将样本序列与从GenBank数据库中下载的参考序列进行序列分析。使用MEGA7程序构建系统进化树,使用Megaligement进行同源性分析。

2 结果与分析

2.1 不同场区PCV2和PCV3阳性率比较

研究表明,检测的7个规模化养猪场均存在PCV2和PCV3感染。其中有45份样品中检出PCV2阳性,阳性率为 3 . 2 1 % ;有463份样品中检出PCV3阳性,阳性率为 3 3 . 0 0 % ;只有11份样品同时检测为PCV2和PCV3阳性,检出率为0 . 7 8 % 。其中,C场阳性率最高,PCV2阳性率为7 . 4 6 % ,PCV3阳性率为 6 4 . 1 8 % (36/134),PCV2和PCV3混合感染率为 3 . 7 3 % ;F场阳性率最低,PCV3阳性率为 2 . 7 5 % (10/364),PCV2无检出。PCV3在新疆规模化养猪场流行率远高于PCV2,且出现PCV2和PCV3混合感染。表3

表3 各猪场PCV2和PCV3阳性率变化Tab.3 ChangesofthePCV2andPCV3

2.2 不同类型样品PCV2和PCV3阳性率比较

研究表明,在各类型样品中,乳猪睾丸液样品PCV2和PCV3阳性率最高,PCV2阳性率为4 . 7 8 % (25/523);PCV3阳性率为 5 7 . 3 6 % ( 523),PCV2和PCV3同时检出的样品有乳猪丸液(3. 7 3 % ,5/523)脐带样( 1 . 9 2 % ,3/86)组织样 ( 1 . 7 5 % , 3 / 2 0 0 ) 。表4

2.3 不同阶段猪群血清 P C V2 + P C V3 阳性率

研究表明,在208份血液样品中,PCV2阳性检出率最高的是乳猪血清 3 . 2 3 % (1/31);PCV3阳性检出率最高的是乳猪血清 4 8 . 3 9 % (15/31)。仅1份乳猪血清同时检出PCV2和PCV3,检出率为 3 . 2 3 % 。表5

2.4 不同季度样品PCV2和PCV3阳性率

研究表明,在1403份样品中,第1季度检测252份样品,第2季度检测486份,第3季度检测501份,第4季度检测164份。PCV2阳性率从高到低依次是第4季度 5 . 4 9 % (9/164)第1季度4 . 3 7 % (11/252)第2季度 2 . 6 7 % (13/486)第3季度2. 4 0 % (12/501);PCV3阳性率从高到低依次是第3季度 3 6 . 3 3 % (182/501)、第2季度3 3 . 9 5 % (165/486)第1季度 2 8 . 1 7 % (71/252)、第4季度 2 7 . 4 4 % (45/164)。PCV3在1年4季的检出率均较高。表6

表4 各类型样本PCV2和PCV3阳性率表5样品血清PCV2和PCV3检出率Tab.5 SerumPCV2andPCV3表6 各季度样品PCV2和PCV3阳性率 Tab.6PositivedetectionratesofPCV2 andPCV3perquarterofsamples

2.5 基因序列的比较

研究表明, P C V 3- X J- 0 0 7 与参考序列之间的同源性最高的为福建KP1株(MF589111.1)9 9 . 7 % ,与参考序列之间的同源性最低的是新疆株、广西株为 9 8 . 3 % 。 P C V 3- X J- 0 0 8 与参考序列之间的同源性最高的为江西S1株(MF589133)9 9 . 4 % 。与参考序列之间的同源性最低的是江西62株(KY075989)为 9 8 . 8 % 。图1

2.6 PCV3ORF2基因遗传进化

研究表明, 与福建株MF589111和福建株MF589108属于同一分支,为PCV3c型毒株。PCV3-XJ-008 与江西株MF589133和江西株MF589107属于同一分支,为PCV3b型毒株。

3讨论

3.1PCV2感染后会影响仔猪生,引起母猪繁猪障碍,且保育猪和生长育肥猪会出现体型消瘦和咳嗽、打喷嚏等呼吸系统疾病2]。PhanTG等[3]报道了PCV3在患病母猪中检出。PCV3可以引起多系统炎症综合征、繁殖障碍疾病、猪皮炎与肾病综合征以及亚临床感染,影响猪群健康状态,但不会表现出明显的临床症状。

3.2回卫荣等报道显示,2015至2019年河北省PCV2的感染率为 4 4 . 0 8 % ~ 8 6 . 8 9 % ,PCV3阳性率为 2 5 . 6 % ,而PCV2和PCV3混合感染率为1 2 . 1 % 。甘雨等[10]报道,在1408份样品中,PCV2阳性率为 5 1 . 9 2 % (731/1408),PCV3阳性率为3 3 . 4 5 % (471/1408),PCV2和PCV混合感染率2 5 . 0 7 % (353/1408)。钟顺平等[1研究表明,在

2019年云南省勐腊县PCV2阳性检出率为 3 6 . 0 5 % (31/86),PCV3阳性检出率 1 7 . 4 4 % (15/86),PCV2和PCV3混合感染率为15. 12 % (13/86)。颜友荣等[调查表明,苏中地区PCV2阳性率为 1 0 . 7 % (39/363)。陈翔鸿等[3调查表明,2019年至2020年我国中南地区猪场中猪PCV2阳性率为 3 6 . 0 8 % (616/1707)。黄正波等[14]研究表明,2021年东北地区PCV2阳性率为 1 9 . 0 0 % (38/200)。高诗敏等[15]对2019年山西省PCV3 阳性率调查结果显示,阳性率为 8 5 . 2 2 % (444/521)。刘文波等[在2020至2022年广西猪圆环病毒3型调查发现,样品阳性率为 1 7 . 8 3 % ( 4 1 / 2 3 0 ) 。黄梦杰等[17对2021至2022年山东省1040份样品检测。结果显示PCV3检出率为 2 . 3 % (24/1040),不同季节和阶段均可检出。刘东旭等[18]在吉林省研究调查表明PCV3阳性率为 3 4 . 2 % ( 2 4 1 / 7 0 4 ) 。李蕊等[9]对北京市的调查研究显示PCV3总体阳性率为 1 . 0 % (12/1177)。李静等[20在2019年9月至2020年12月期间对新疆阿克苏地区、巴音郭楞蒙古自治州、伊犁哈萨克自治州等6个地区PCV3阳性率研究表明,北部地区PCV3平均阳性率为 1 4 . 5 % ( 6 5 / 449)。袁科等21报道,在2021年10月至2022年7月新疆北部地区PCV3阳性率为 2 4 . 1 5 % (107/443),且不同阶段猪群均可感染。莫绍江等[22]调查表明,阿克苏部分地区PCV3阳性率为 7 . 5 3 % (44/584)。

3.3研究表明,新疆PCV2总体阳性率 3 . 2 0 % ,低于苏中地区的 1 0 . 7 % ;低于中南地区的 3 6 . 0 8 % ;低于东北地区的 1 9 . 0 0 % ;整体阳性率处于全国较低水平,PCV3总体阳性率为 3 3 . 0 % (463/1403),高于李静等( 1 4 . 5 % )、袁科等( 2 4 . 1 5 % )和莫绍江等( 的研究结果,相较于山西低5 2 . 2 2 % ;比山东高 3 0 . 7 % ;比北京高 3 2 . 0 0 % ;比广西高 1 5 . 1 7 % ,与甘雨等[10]( 3 3 . 4 5 % ,471/1408)和刘旭东等[18]( 3 4 . 2 % 2 4 1 / 7 0 4 )研究结果相接近。PCV2和PCV3混合感染率( 7 . 8 4 % )低于河北0 1 2 . 1 % )、云南( 1 5 . 1 2 % )混合感染率。目前尚无一款商品化PCV3疫苗,解除PCV2感染造肥的机体免疫抑制,增强自身健康情况,降低PCV3感染风险[23],减少PCV2和PCV3混合感染率。

4结论

目前,在新疆PCV2阳性率为 3 . 2 0 % ( 4 5 / 1403),PCV3流行率达 3 3 . 0 0 % (463/1403),

PCV2和PCV3混合感染率为 7 . 8 4 % (11/1403)。C 场PCV2和PCV3阳性检出率最高,PCV2为7 . 4 6 % (10/134),PCV3为 6 4 . 1 8 % (36/134),PCV2和PCV3混合感染率为 3 . 7 3 % (5/134)。新生乳猪睾丸检出PCV2和PCV3阳性率最高,PCV2阳性率为 4 . 7 8 % (25/523);PCV3检出率为5 7 . 3 6 % (300/523)。PCV2和PCV3不仅可以感染不同阶段的猪只,而且一年四季感染率较高。新疆部分地区,PCV2感染率处在全国低等水平,PCV3感染率处于全国中等水平,且新疆部分地区PCV3流行毒株为PCV3b和PCV3c型。

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Monitoring of Porcine circovirus (PCV) types 2 and 3 in some large - scale pig farms in Xinjiang

QI Weiyi1,XU Heng²,LIU Yingyu¹,ZHENG XIA Lining,LIU Junfei²

(1. College of Animal Medicine, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830o52,China; 2. Xinjiang Tekon Animal Husbandry Science and Technology Co. Ltd. ,Changji Xinjiang 8311oo, China)

Abstract:【Objective】 To investigate the prevalence of Porcine circovirus type 2(PCV2) and Porcine circovirus type 3(PCV3)in Xinjiang.【Methods】From October 2022 to September 2023,1403 samples from 7 large- scale pig farms were detected and sequenced by fluorescent quantitative PCR. 【Results】The overall positive rate of PCV2 was 3 , 2 0 % (45/1403),the overall positive rate of PCV3 was 3 3 . 0 0 % (463/ 1403),and the combined infection rate of PCV2 and PCV3 was 7 . 8 4 % (11/1403). The positive detection rate of PCV2 and PCV3 in C field was the highest,with PCV2 7 . 4 6 % (10/134),PCV3 64.18%(36/134), and PCV2 and PCV3 mixed infection rate 3 . 7 3 % (5/134). The positive rate of PCV2 and PCV3 was the highest,and the positive rate of PCV2 was 4 . 7 8 % (25/523). The detection rate of PCV3 was 57.36%(300/ 523).The detection rates of PCV2 and PCV3 were high in allseasons,and the PCV3 strain was PCV3b and PCV3c.【Conclusion】PCV3 infection has been found in some large - scale pig farms in Xinjiang and the prevalence rate of PCV3 is much higher than that of PCV2,and PCV3 strain is PCV3b and PCV3c.

Key words:Porcine circovirus type 3; Porcine circovirus type 2; fluorescent quantitative PCR; pig

标签:  阳性 

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